L'istruttoria è la fase che segue la richiesta di ottenere un mutuo: durante l'istruttoria la banca compie una attenta valutazione delle capacità di rimborso dei richiedenti. Sono in particolare oggetto di valutazione la "capacità di credito" (volta tra l'altro a verificare eventuali insolvenze passate dei richiedenti), la "capacità di reddito" (attitudine a produrre nel tempo un reddito sufficiente a pagare le rate del mutuo) e il valore del bene immobile su cui si iscriverà l'ipoteca.
Qualora l'esito dell'istruttoria non fornisca sufficienti garanzie di restituzione del prestito, la banca respinge la richiesta.